Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Krt20Q9D312 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms