Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vsig1Q9D2J4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms