Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc8Q9D2H8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms