Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap5-3Q9D226 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms