Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd3Q9D176 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd3Q9D176 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms