Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc3Q9D114 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms