Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem53Q9D0Z3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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