Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Exosc7Q9D0M0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms