Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed3Q9D0L1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms