Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf146Q9CZW6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf146Q9CZW6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rnf146Q9CZW6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rnf146Q9CZW6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf146Q9CZW6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf146Q9CZW6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms