Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mis18aQ9CZJ6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mis18aQ9CZJ6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms