Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp11Q9CZJ1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms