Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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