Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snf8Q9CZ28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snf8Q9CZ28 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snf8Q9CZ28 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms