Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zcchc8Q9CYA6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc8Q9CYA6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms