Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr55Q9CX97 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Wdr55Q9CX97 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms