Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufaf1Q9CWX2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms