Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Filip1Q9CS72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms