Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tm4sf20Q9CQY8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tm4sf20Q9CQY8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tm4sf20Q9CQY8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tm4sf20Q9CQY8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tm4sf20Q9CQY8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tm4sf20Q9CQY8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tm4sf20Q9CQY8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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