Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg12Q9CQY1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg12Q9CQY1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms