Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ8

Lsm7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm7Q9CQQ8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm7Q9CQQ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm7Q9CQQ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms