Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdm1Q9CQK3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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