Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms