Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms