Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ClpsQ9CQC2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ClpsQ9CQC2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms