Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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