Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms