Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim8Q99PJ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms