Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RetnQ99P87 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RetnQ99P87 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms