Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms