Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atoh8Q99NA2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atoh8Q99NA2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atoh8Q99NA2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms