Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q99M08 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q99M08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q99M08 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q99M08 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms