Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms