Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pagr1aQ99L02 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms