Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TriobpQ99KW3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms