Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf34Q99KR6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms