Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab28Q99KL7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab28Q99KL7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms