Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TrabdQ99JY4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TrabdQ99JY4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrabdQ99JY4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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