Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tlcd1Q99JT6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms