Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdelr1Q99JH8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms