Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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