Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms