Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smc6Q924W5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc6Q924W5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms