Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubxn1Q922Y1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms