Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prpf3Q922U1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms