Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg13Q91YI1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms