Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atl3Q91YH5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms