Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms