Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenomQ8VHC3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenomQ8VHC3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms