Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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